Kapitel IX. Streit zwischen Theophilus und Petrus, der zu einem Versuch des Ersteren führt, Johannes als Bischof von Konstantinopel abzusetzen.
Nicht lange danach kamen die Wüstenmönche zusammen mit Dioskurus und seinen Brüdern nach Konstantinopel. Bei ihnen war auch Isidor, der früher der engste Freund des Bischofs Theophilus war, dann aber zu seinem erbittertsten Feind wurde, und zwar aufgrund folgender Tatsache: Ein gewisser Petrus war zu jener Zeit Erzpriester der Kirche von Alexandrien; Theophilus, der über diese Person verärgert war, beschloss, ihn aus der Kirche zu vertreiben; und als Grund für den Ausschluss erhob er gegen ihn die Anklage, eine Frau der manichäischen Sekte zur Teilnahme an den heiligen Mysterien zugelassen zu haben, ohne sie vorher zu zwingen, ihrer manichäischen Häresie abzuschwören. Als Petrus zu seiner Verteidigung erklärte, dass nicht nur den Irrtümern dieser Frau zuvor abgeschworen worden war, sondern dass Theophilus selbst ihre Zulassung zur Eucharistie gebilligt hatte, wurde Theophilus entrüstet, als ob er schwer verleumdet worden wäre; daraufhin beteuerte er, dass er von diesem Umstand nichts wisse. Petrus rief daraufhin Isidor zu sich, um zu bezeugen, dass der Bischof von den Tatsachen über die Frau wusste. Isidor befand sich zu jener Zeit in Rom, wo er im Auftrag des Theophilus zu Damasus, dem Prälaten der Kaiserstadt, reiste, um eine Versöhnung zwischen ihm und Flavian, dem Bischof von Antiochien, herbeizuführen; denn die Anhänger des Meletius hatten sich von Flavian getrennt, weil sie seinen Meineid verabscheuten, wie wir bereits festgestellt haben. Als Isidor aus Rom zurückkehrte und von Petrus als Zeuge vorgeladen wurde, sagte er aus, dass die Frau mit Zustimmung des Bischofs empfangen worden sei und dass er selbst ihr das Sakrament gespendet habe. Daraufhin wurde Theophilus wütend und warf beide aus Zorn hinaus. Dies war der Grund dafür, dass Isidor mit Dioskurus und seinen Brüdern nach Konstantinopel ging, um dem Kaiser und Johannes, dem Bischof, die Ungerechtigkeit und Gewalt, mit der Theophilus sie behandelt hatte, zur Kenntnis zu bringen. Als Johannes von den Tatsachen erfuhr, nahm er die Männer ehrenvoll auf und schloss sie nicht von der Gebetsgemeinschaft aus, sondern verschob ihre Teilnahme an den heiligen Mysterien, bis ihre Angelegenheiten untersucht worden waren. Während sich die Dinge in dieser Lage befanden, wurde Theophilus ein falscher Bericht zu Ohren gebracht, dass Johannes sie sowohl zur Teilnahme an den Mysterien zugelassen habe als auch bereit sei, ihnen Beistand zu leisten; deshalb beschloss er nicht nur, sich an Isidor und Dioskur zu rächen, sondern auch, wenn möglich, Johannes von seinem bischöflichen Stuhl zu stoßen. Mit diesem Vorsatz schrieb er an alle Bischöfe der verschiedenen Städte und verurteilte darin, sein wahres Motiv verbergend, scheinbar nur die Bücher des Origenes, die sein Vorgänger Athanasius in seinen Reden gegen die Arianer zur Bekräftigung seines eigenen Glaubens benutzt und sich häufig auf das Zeugnis und die Autorität der Schriften des Origenes berufen hatte.
