Kapitel XVII. Konflikt zwischen den Konstantinopolitanern und Alexandrinern wegen Heraklit; Flucht des Theophilus und der Bischöfe seiner Partei.

In erster Linie versuchte Theophilus also, den Fall der Ordination des Heraklides zu untersuchen, um auf diese Weise vielleicht eine Gelegenheit zu finden, Johannes erneut abzusetzen. Heraklides war bei dieser Untersuchung nicht anwesend. Dennoch wurde er in seiner Abwesenheit verurteilt, weil er einige Personen ungerechtfertigt geschlagen und anschließend in Ketten mitten durch die Stadt Ephesus geschleift hatte. Als Johannes und seine Anhänger gegen die Ungerechtigkeit des Urteils über eine abwesende Person protestierten, behaupteten die Alexandriner, dass sie die Ankläger des Heraklides anhören müssten, obwohl dieser nicht anwesend war. Daraufhin entbrannte ein heftiger Streit zwischen den Alexandrinern und den Konstantinopolitanern, und es kam zu einem Aufruhr, bei dem viele Menschen verwundet und einige getötet wurden. Als Theophilus sah, was geschehen war, floh er ohne Zeremonie nach Alexandria, und die anderen Bischöfe, mit Ausnahme der wenigen, die Johannes unterstützten, folgten seinem Beispiel und kehrten an ihre jeweiligen Sitze zurück. Nach diesen Vorgängen war Theophilus in jedermanns Ansehen herabgesetzt; aber das Odium, das ihm anhaftete, wurde durch die schamlose Art und Weise, in der er fortfuhr, die Werke des Origenes zu lesen, noch vergrößert. Und als er gefragt wurde, warum er das, was er öffentlich verurteilt hatte, so duldete, antwortete er: "Die Bücher des Origenes sind wie eine Wiese, die mit Blumen aller Art übersät ist; wenn ich also zufällig eine schöne unter ihnen finde, so pflücke ich sie; was mir aber dornig erscheint, das übergehe ich, wie das, was stechen würde ". Aber Theophilus gab diese Antwort, ohne über den Spruch des weisen Salomo nachzudenken, dass "die Worte der Weisen wie Stacheln sind "; und wer von den darin enthaltenen Vorschriften gestochen wird, soll nicht dagegen treten. Aus diesen Gründen wurde Theophilus von allen Menschen verachtet. Dioskurus, der Bischof von Hermopolis, einer von denen, die man "die großen Mönche " nannte, starb kurz nach der Flucht des Theophilus und wurde mit einem prächtigen Begräbnis geehrt und in der Kirche "Zur Eiche " beigesetzt, wo die Synode auf Veranlassung des Johannes einberufen wurde. Johannes war unterdessen eifrig mit dem Predigen beschäftigt. Er weihte Serapion zum Bischof von Herakleia in Thrakien, wegen dem das Odium gegen ihn erhoben worden war. Bald darauf ereigneten sich die folgenden Ereignisse.